Preocuparea continua a Institutului San Rafael consta in imbinarea activitatii clinice, de cercetare si educatie inca din 1971 cand centrul a luat fiinta si a inceput sa reprezinte un prim exemplu de spital complet independent privat din Italia. Putin timp dupa infiintarea sa, San Raffaele a primit titlul de Spital de Cercetare (IRCCS), fiind favorizata dezvoltarea acestuia ca un site pentru cercetare clinica, initial specializata in diabet si tulburari metabolice.

In 1992, San Raffaele s-a extins prin inaugurarea DIBIT, constructie destinata stiintei fundamentale, cu un spatiu pentru cercetare de aproximativ 12.000 metri patrati, unde in present lucreaza 250 de angajati , cercetatori si clinicieni, oameni de stiinta, tehnicieni si personal administrative, alaturi de 300 de interni, consultanti, studenti stagiari si absolventi de facultate. DIBIT este cel mai mare parc stiintific biomedical din Italia si include Spitalul San Raffaele cu peste 1300 de paturi, Parcul Stiintific Raf  creat pentru a sprijini  realizarea obiectivelor fundatiei, precum si Universitatea Vita-Salute San Raffaele.

Din anul 2007, al doilea proiect DIBIT (DIBIT-2) isi va extinde spatiul dedicat cercetarii de 3 ori si va creste substantial si abilita cercetarea in diferitele domenii de activitate in care San Rafaelle a devenit renumit. Avand in vedere interactiunile pe care DIBIT le are cu Spitalul San Raffaele, cu Parcul stiintific Raf si cu Universitatea, este firesc sa credem ca, la randul său, această extindere va permite imbunatatirea logisticii si organizarii in scopul rationalizarii activitatii clinice, a catalizarii atentiei industriei si la atragerea celor mai buni studenti.   

 Mult efort si numeroase resurse au fost investite in cercetarea fundamentala preclinica si clinica. Realizarile noastre stiintifice continua sa demonstreze un impresionant progres atat prin numarul crescut de publicatii cat si prin continutul calitativ. In 2006, 678 de lucrari stiintifice au fost publicate, cu un factor de impact de 3400. Aceste cifre confirma pozitia fruntasa, de leader, a Institutului in Italia, precum si abilitatea de atragere a suportului financiar din surse publice (Ministerul Sanatatii, Institutul Superior de Sanatate, Ministerul Universitatii si Cercetarii, Comunitatea Europeana, NIH si, cu o contributie modesta, CNR) si private, incluzand fundatiile de caritate (in principal Telethon, Asociatia Italiana de Cercetare in domeniul Cancerului si Fundatii Bancare) si reprezinta baza solidei reputatii internationale dobandite de-a lungul anilor. Telethon a fondat doua centre de cercetare in San Raffaele : Institutul San Raffaele-Telethon de Terapie Genetica a Bolilor Genetice (HSR-TIGET) care a experimentat in pionierat aplicatia clinica a tehnologiei de transfer genetic si Institutul de Cercetare a Celulelor Stem (SCRI), care studiaza biologia si potentialul clinic al aplicatiilor de celule stem, un domeniu in care Institutul San Raffaele este leader mondial.

Unitatea EBP gazduieste Laboratorul TB Supranational de Referinta, laborator recunoscut de Organizatia Mondiala a Sanatatii, sub conducerea lui D. Cirillo cu mandatul de a furniza formare profesionala, asistenta tehnica si de asigurare a calitatii retelei nationale de TB din tarile endemice selectate.

Obiective de cercetare:

1. Controlul tuberculozei multidrog rezistente (TB): de la sanatatea publica catre cercetarea fundamentale si aplicata.   
   • Diagnosticul rapid al rezistentei la droguri (DR)  facilitat de abordarea moleculara ramane unul din instrumentele cele mai puternice de imbunatatire rapida a managementului pacientului, si, prin urmare, ajuta la controlul raspandirii TB rezistente la droguri (DR). Astfel, scopul nostru este de a identifica mutatiile implicate in fenotipuri rezistente, în special pentru a doua linie de droguri si pentru noile medicamente, prin analiza regiunilor genomice dinafara genelor bine caracterizate. Testele usor de executat  pentru detectarea mutatiilor vor fi dezvoltate prin intermediul tehnologiei moleculare de varf disponibile si transferabile in asezarile cu venituri mici dar cu incidenta crescuta a TB, in scopul imbunatatirii diagnosticului multidrogrezistentei (MDR).
   • Bacilii tuberculosi simt mediul gazdei si se modifica prin trecerea la o forma persistenta (non-replicativa) formă, care are o sensibilitate redusa la agentii fizici si chimici, precum si la majoritatea medicamentelor antimicrobiene. S-ar putea afirma ca aceasta transformare (switch-rasucire), care implica modificarea ratei de crestere, de absorbtie a substratului, a fluxurilor intracelulare şi utilizarea caii respiratorii, ii face pe bacilii tuberculosi rezistenti la actiunea bactericida a macrofagelor. Se investigheaza (i) programul de transcripţie, profilul non-codantului ARN mic (sARN), precum şi statusul metabolic al agentului patogen inainte, in timpul si dupa transformare (rasucire); (ii) evenimentele de reglementare asociate cu procesul de transformare, comutare (switch) şi (iii) consecintele fenotipice . Din moment ce sARN reglementeaza virulenta bacteriena, rezistenta la stress si homeostazia fierului, se poate a emite ipoteza  contributiei sARN la modularea transformarii catre persistenta.
2. Caracterizarea moleculara a microorganismelor MDR pentru controlul infectiei si studiile epidemiologice in populatie selectata